SDA  7.1
Simulation of Diffusional Association
 All Classes Files Functions Variables Groups Pages
Class Index
A | B | C | F | G | L | M | N | O | P | R | S | T
  a  
  l  
mod_geometry   mod_flexibility::nodeflex   
  s  
mod_grid   
  o  
alltimer   mod_flexibility::list_flex_type   mod_gridtype   mod_setofgrid::sogrid   
mod_analytic::analytic   mod_record::listcomplexe   mod_hydrodynamics   mod_onecomplexe::one_complexe   mod_geometry::sphere   
mod_array_protein::array_protein_type   
  m  
mod_init_position   
  p  
  t  
mod_rate_calculation::association_rate   mod_input_parameter   
mod_van::atom_tcharge   mod_analytic   mod_interface   par_zig_mod   mod_record::trajectory   
mod_van::atom_van   mod_array_protein   mod_ljgrid   mod_input_parameter::param_list   mod_type_calc::type_calculation   
  b  
mod_compute_analytic_2proteins   mod_onecomplexe   mod_input_parameter::param_list_tools   mod_force_energy::type_force_energy   
mod_compute_analytic_sdamm   mod_protein   com_sda::parameter_analytic   mod_grid::type_grid   
mod_geometry::box   mod_compute_energy   mod_rate_calculation   com_sda::parameter_metaldesolv   mod_exclusion_grid::type_grid_excl   
  c  
mod_compute_energy_flex   mod_reactioncriteria   com_sda::parameter_pmf   mod_ljgrid::type_ljgrid   
mod_compute_energy_sdamm   mod_record   com_sda::parameter_timestep   com_sda::type_option_omp   
change_conformation   mod_compute_force   mod_residencetime   com_sda::probe_type   mod_ljgrid::type_position_atom   
com_sda   mod_compute_force_sdamm   mod_set_parameters   mod_protein::protein   mod_grid::type_uhbd_grid   
  f  
mod_compute_image_charge   mod_setofgrid   
  r  
mod_van::type_van   
mod_compute_metaldesolv   mod_type_calc   
mod_flexibility::flexible   mod_compute_pmf   mod_van   mod_reactioncriteria::react_criter   
  g  
mod_exclusion_grid   alltimer::mytimer   mod_interface::read_value   
mod_flexibility   
  n  
mod_record::record   
mod_geometry::geometry   mod_force_energy   mod_residencetime::residence_time   
mod_record::nodecomplexe   
A | B | C | F | G | L | M | N | O | P | R | S | T